《廣州內河港總體規(guī)劃》將廣州內河港口劃分為番禺港區(qū)、五和港區(qū)和新塘港區(qū)等3大港區(qū)，其中番禺港區(qū)劃分為東沙、沙灣、蕉門、大崗和萬頃沙5個作業(yè)區(qū)；五和港區(qū)分為赤坭、花都港、神山、石井和流溪河5個作業(yè)區(qū)；新塘港區(qū)分為新塘、仙村、石灘和荔城4個作業(yè)區(qū)； 《廣州港總體規(guī)劃》明確廣州港包括內港口港區(qū)、黃埔港區(qū)、新沙港區(qū)、南沙港區(qū)和珠江口水域，內港區(qū)今后的發(fā)展除保留那些具有一定地理優(yōu)勢及特點的港口作業(yè)區(qū)外，將把貨運功能逐步外遷、結合城市發(fā)展實施綜合開發(fā)。外港區(qū)是廣州港以集裝箱和石油、煤  炭、鐵礦石等能源、原材料為主的綜合性港區(qū)，是廣州港發(fā)展的重點。廣州內河港總體規(guī)  劃、廣州港總體規(guī)劃為碧道路徑選擇和建設提供了基礎條件，碧道建設應避繞或以合理方式穿越碼頭設施和港口規(guī)劃岸線，并在后期實施方案階段征求港務局和相關港口意見。